Факультет судноводіння

Факультет судноводіння	Факультет економіки транспорту	Юридичний факультет	Відокремлені структурні підрозділи
Кафедра судноводіння і управління судном	Кафедра економіки і менеджменту	Кафедра транспортного права	Коледж морського та річкового флоту
Кафедра суднових енергетичних установок, допоміжних механізмів та їх експлуатації	Кафедра обліку і аудиту	Кафедра цивільного права	Київський тренажерний центр підготовки, перепідготовки та підвищення кваліфікації фахівців водного транспорту
Кафедра технічних засобів судноводіння та радіозв’язку	Кафедра інформаційних технологій	Кафедра правосуддя	Севастопольський морський коледж
Кафедра природничих і технічних дисциплін	Кафедра математики	Кафедра кримінального права	Севастопольський факультет морського транспорту
Кафедра англійської мови за професіним спрямуванням	Кафедра економічної теорії	Кафедра теорії та історії держави і права	Дунайський навчально-консультативний пункт КДАВТ
Кафедра суспільних дисциплін	Кафедра перевезень і маркетингу		Навчально-консультаційний центр КДАВТ в м. Ізмаїл
Кафедра суспільних дисциплін	Кафедра перевезень і маркетингу		Навчально-консультаційний центр КДАВТ в м. Миколаєві
Кафедра української та іноземних мов			Професійно-технічне училище «Миколаївська морехідна школа»
Кафедра фізичного виховання
Центр довузівської підготовки
Відділ аспірантури